光和七年四月，太祖迁五官中郎将，持节，东攻卜己，虑麾下皆骑，乃调普部，普率部日行百里，五月即至。时黄巾梁远部欲汇卜己，普、顺率步卒二千当道而阻之，贼二万，攻其半日，不动如山，太祖师至，贼破，东郡乃平，战后封赏，普特进校尉。

然普以豪勇，多行激烈事。一日，将征，太祖解其氅覆普背，复谓普曰：“卿之豪勇，吾固知也，昔日征鲜卑，非卿斥手夺贼刃，救吾于危难中，几不得免。然时事易矣，卿今日欲为大将，不可止豪勇，亦当持重！普感念下拜，自此渐为大将之才。”

后太祖将至洛，忧鲜卑为祸桑梓，以普持重，表为雁门都尉。鲜卑轲比能部袭扰幽并，为普所退。汉中平六年前泰山太守张举举族反叛，勾结鲜卑、乌桓，破卢龙塞，莫敢当者，普率军与战，三战皆胜，纯败逃塞外。七月，董卓为祸，普以建威将军领辽西太守应太祖檄文往盟，太祖以方面任之，曰：“前，吾与诸将共往，后，有德谋无忧”。

普顾大局，善克己，建安二年，太祖平河北，废司隶校尉，改程普为镇南将军，领司州牧，委以屯田事。普素好酒善饮，及任，滴酒不沾，左右奇曰：将军何故至此？普曰：“大战方休，粮秣所耗者甚，今吾一人乏饮一日，可供数家一日之餐”，左右拜服，下皆效之，民粮不乏。及秋，粮大熟，普连饮数日不止。

建安六年，官渡战起，太祖以普为前营指挥，普连营三十里叠叠向前。操因前战不利，欲夺先声，数与普战，无果，束手无策，乃使人骂曰：“普数战无功，此一将无能，累死三军也。”军中闻之皆请战，普闻之，虽忿，旧岿然不动。后有军吏复告太祖，太祖拊掌曰：“岂不闻，善战者无赫赫之功乎，德谋可托大事。”军中遂安。九月，战机至，普领兵向前，所向皆破，操弃营而走。

开元元年，太祖受禅登极，普受封万户，领司州牧。

普性达观，喜谐。开元十三年二月，普染沉疴，太祖往视，普不能起，太祖语普曰：“光阴似矢，朕与卿皆老矣，今有愿否？”普曰：“陛下万寿，万勿言此，臣能从陛下扫平四方，儿孙满堂，其滋味如饮醇醪，平生足矣。”及太祖归，其子咨垂泪不止，普视之，捶榻叹曰：“悔矣，今有一愿，忘语陛下。”咨忙问之。普曰：“昔闻陛下割瓶赠酒，以遗英豪，吾时处幽州，憾不能…。”声近不可闻，咨忙拭泪曰：“儿即追陛下，叩请陛下赐酒。”将奔，普忽亮音曰：“谬矣，吾想请陛下告吾，酒自何处购也”。言罢大笑不止，咨破涕为笑。

三月，普病益重，乃召诸子，正色曰：“今吾将亡，有一言告汝等。吾素喜饮酒，然有度，今后辈皆效吾喜饮，但不自持，久必为祸，吾死，程门当禁酒也，切记之。”诸子称喏，普使其呼“今日程门当禁酒”，如是者三，乃卒。时普曾任司州牧，重治安，故多有司州吏员在侧，闻之，以普遗愿，乃告洛阳诸门，“今日城门当禁酒”。后孝庄太后闻之，笑与太祖语：“哀家思过往，确当城门处禁酒”。遂为定制，因事源普，后皆呼曰：“城门普检”，延续至今。

谥曰武昭，子咨嗣。